Análisis de imagen para registrar el crecimiento de plántulas

Una vez puesta a punto la técnica para realizar la germinación de semillas de forma controlada comenzamos a hacer las primeras observaciones de control. Regularmente, generalmente cada 12 horas, tomábamos una foto de la perparación que habíamos realizado. En cada una de ellas sembramos tres semillas.

Comprobamos cómo las semillas germinaban y sus raíces comenzaban a crecer. Sus  trayectorias eran generalmente curvas, por lo que medirlas con exactitud no era fácil. También nos interesaba conocer el ángulo de crecimiento de la raíz con respecto al punto de inicio para determinar la direccionalidad de la respuesta.

ImageJ. Programa de análisis de imagen para preparaciones biológicas.

Para todo esto, decidimos que lo mejor era usar algún programa de análisis de imagen. Nuestro profesor nos propuso ImageJ.

Parece un programa muy simple, pero en realidad es muy potente y versátil, ya que existen multitud de tareas para las que se han diseñado plugins específicos.Como parte de la formación de nuestro proyecto, dedicamos una sesión a aprender a usar dicho programa para medir el crecimiento de las plantas.

Primero era necesario calibrar cada imagen empleando para ello alguna distancia conocida, ya que no todas las fotos estaban realizadas exactamente a la misma distancia. Luego practicamos para aprender a trazar y medir lineas segmentadas, lo que nos permitía ajustar la medida con bastante precisión a la forma exacta de cada raíz. También aprendimos a medir ángulos formados por una trayectoria con respecto a la horizontal. Esto nos permitió expresar de una forma sencillla no sólo la velocidad sino también la dirección del crecimiento de las raíces.

Medida de longitud de raíces de plántulas de soja, empleando el programa ImageJ

Comenzamos a registrar todos nuestros datos en tablas para comprobar la utilidad de la técnica y tener datos de referencia para saber cómo crecen las plantas en condiciones de gravedad normales.